تشخیص تفریقی از جمله مهمترین ابزارها در تشخیص صحیح مشکل یا بیماری حیوان است. به این جهت در ذیل مهمترین علائم و تشخیص های احتمالی تقدیم می گردد.
1 - از دست رفتن اشتها : کوکسیدیوزیس ، انتروتوکسمیا ، سوء هاضمه و اختلال در جذب مواد غذایی ، کتوزیس ، لیستریوزیس ، ورم پستان ، توکسمی آبستنی ، بیماریهای تنفسی
2 - سقط جنین : بر اثر غیرطبیعی بودن رشد جنین ، عوامل عفونی شامل : بروسلوزیس ، کمپیلوباکتر ، کلامیدیا ، لپتوسپیروزیس ، نئوسپوروزیس ، تب Q ، سارکوسیستوزیس ، تب کنه ای ، توکسوپلاسموزیس - عدم کفایت جفت بر اثر چند قلو بودن و عوامل ناشی از استرس و تروما
3 - آبسه ها : لنفادنیت کازئوز ، عوامل عفونی
4 - قوسی شدن پشت حیوان : درد و کولیک
5 - سفتی پاهای عقبی و عدم توانایی استفاده حیوان از آنها : بیماری عضله سفید
6 - نابینایی : کلامیدیا ، پولیوانسفالومالاسی ، زخم چشم
7 - تاول : تب برفکی ، زخم دهان
8 - نفخ : اسیدوزیس ، نفخ
9 - کشیدن بدن و باز گذاشتن پاها : کولیک ، سنگ های ادراری
10 - سختی یا افزایش تعداد تنفس : اسیدوزیس ، مشکلات ریوی
11 - تشنج : کزاز
12 - سرفه های مزمن : CAE (Caprine Arthritis Encephalitis Virus) ، کرم های ریوی ، مشکلات ریوی
13 - ناله و فریاد زدن : کولیک ، ورم پستان ، سنگ های ادراری ، بیماری عضله سفید
14 - افسردگی : اسیدوزیس ، انتروتوکسمیا ، Floppy Kid Syndrome ، لیستریوزیس ، مشکلات ریوی ، پولیوانسفالومالاسی ، کزاز
15 - اسهال : کوکسیدیوزیس ، انتروتوکسمیا ، کرمهای گرد معدی - روده ای ، بیماری یون ، پولیوانسفالومالاسی ، کمبود عناصر معدنی
16 - اختلال رفتاری گنگ : اسیدوزیس ، انتروتوکسمیا ، لیستریوزیس ، پولیوانسفالومالاسی ، کزاز
17 - تب : کوکسیدیوزیس ، انتروتوکسمیا ، عفونت ، لیستریوزیس ، پولیوانسفالومالاسی ، مشکلات ریوی
18 - کف در دهان : نفخ
19 - ریزش مو : مشکلات قارچی پوست
20 - خارش : شپش ، جرب ، کنه
21 - لنگش : CAE ، آرتریت دژنراتیو ، تب برفکی ، گندیدگی سم ، جسم خارجی در سم ، شکستگی و آسیب مفصل یا بافت نرم ، توکسمی آبستنی و ...
22 - فلجی پاها : کزاز ، کمبود عناصر معدنی ، بیماری عضله سفید
23 - ریزش شدید بزاق : تب برفکی ، لیستریوزیس ، مسمومیت با مایکوتوکسین ها
24 - مرگ ناگهانی : بیماری عضله سفید ، انتروتوکسمی
25 - کاهش وزن : CAE ، کوکسیدیوزیس ، کرمهای گرد معدی - روده ای ، بیماری یون